IDENTIFIKASI MORFOLOGI DAN MOLEKULER KEPITING BRACHYURA MENGGUNAKAN DNA BARCODING GEN COI DI PANTAI DRINGO, WONOGIRI

Oleh :
Almas Nabila Maulida Zharfani - M0419005 - Fak. MIPA

Indonesia memiliki keanekaragaman hayati laut yang tinggi, termasuk kepiting Brachyura yang berperan penting dalam ekosistem pesisir. Wilayah pesisir Dusun Dringo Wonogiri, Jawa Tengah merupakan habitat alami bagi kepiting Brachyura, namun belum tersedia data identitas taksa di lokasi tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan identitas kepiting Brachyura dengan mengintegrasikan karakter morfologi dan analisis molekuler menggunakan gen cytochrome c oxidase subunit I (COI). Spesimen kepiting diperoleh dengan metode jelajah pada lima pantai diantaranya Pantai Nampu, Puyangan, Pringjono, Kwaru, dan Karangpayung. Identifikasi morfologi dilakukan berdasarkan karakter diagnostik kualitatif, serta pola ekologis kepiting. Analisis molekuler meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi PCR gen COI, dan sekuensing Sanger. Data sekuens dianalisis menggunakan BLAST pada GenBank, estimasi jarak genetik (p-distance) dan rekonstruksi filogenetik Maximum Likelihood. Empat belas taksa teridentifikasi. Nilai percent identity sebesar 86,44 –100% serta kesesuaian morfologi dan molekuler didukung oleh kedekatan filogenetik dan jarak genetik rendah terhadap referensi sebagai dasar penentuan identitas taksa. Temuan ini menunjukkan bahwa integrasi morfologi tradisional dengan pengkodean DNA COI mendukung penetapan identitas Brachyura.