Kanker otak merupakan penyakit yang masih menjadi masalah kesehatan di dunia dengan tingkat kematian tinggi. Salah satu pengobatannya, yaitu dengan kemoterapi. Namun, penghantaran agen kemoterapi menghadapi kesulitan untuk masuk ke otak karena terdapat Blood Brain Barrier (BBB). BBB dapat dilewati melalui mekanisme Receptor-mediated transcytosis (RMT) yang melibatkan pengikatan ligan ke reseptor spesifik pada BBB. Reseptor integrin αIIbβ3 terdapat pada tubuh manusia yang mengenali motif ligan peptida Arg-Gly-Asp (RGD). Ligan RGD dapat menginduksi integrin sehingga mengalami efek alosterik. Beberapa faktor, seperti urutan asam amino tetangga RGD dan konformasi ligan RGD dapat mempengaruhi selektivitas dan afinitas integrin. Penelitian ini menganalisis selektivitas dan efek alosterik headpiece integrin αIIbβ3 terhadap RGD siklik (Kode PDB 1L5G). Kompleks headpiece integrin-RGD linear (Kode PDB 3ZDY) digunakan sebagai pembanding. Proses docking dilakukan menggunakan PyRx (AutoDock Vina) dan simulasi Dinamika Molekuler (MD) selama 50 nanoseconds (ns) menggunakan program AMBER20. Hasil analisis sudut dihedral menunjukkan bahwa integrin αIIbβ3 tidak selektif terhadap RGD siklik cilengitide. Namun, analisis RMSD, b-faktor, sudut vektor, dan radius of gyration menunjukkan bahwa dalam simulasi 50 ns, kompleks integrin αIIbβ3-RGD siklik cilengitide mengalami perubahan konformasi sedangkan pada kompleks integrin-RGD linear belum terjadi perubahan konformasi. Ligan RGD siklik cilengitide memberikan efek alosterik terhadap integrin αIIbβ3. Dengan demikian, penggunakan RGD siklik cilengitide pada terapi kanker perlu diperhatikan karena dapat mempengaruhi pembukaan integrin selain pada BBB.
