Abstrak


DETEKSI ACUTE MYELOBLASTIC LEUKEMIA BERBASIS EKSPRESI GEN PADA SEL MONONUKLEAR SUMSUM TULANG MENGGUNAKAN MACHINE LEARNING


Oleh :
Wahyu Misbah Assudur - M0519082 - Fak. Teknologi Informasi dan Sains Data

Kanker adalah penyakit keganasan yang terjadi pada jaringan tubuh dimana terdapat sel-sel abnormal yang tumbuh secara berlebihan dan tidak terkoordinasi. Terdapat 408.661 kasus baru leukemia dan 242.988 kematian akibat leukemia di indonesia. Secara umum, kejadian leukemia lebih banyak terjadi pada laki-laki sebesar 6.4 kasus daripada perempuan sebesar 4.0 kasus dengan kondisi yang terjadi di indonesia.Penelitian ini menunjukkan bahwa PCA (Principal Component Analysis) dapat meningkatkan performa dari algoritma klasifikasi machine learning dalam mendeteksi leukemia AML (Akut Myeloid Leukemia) yang bergantung pada ekspresi gen pada sel mononuklear sumsum tulang.Model yang akan dievaluasi adalah model dengan menggunakan 6 algoritma klasifikasi machine learning, yaitu : Naïve Bayes, Neural Network, Support Vector Machine(SVM), kNN, Random Forest, dan Decision Tree dengan berdasarkan beberapa metode pengukuran diantara lain: confusion matrix, accuracy, precision, recall, F1-score, Area Under ROC Curve, dan Matthew Coefficient Correlation yang bertujuan membandingkan performa model sehingga hasilnya lebih baik dari penelitian sebelumnya.Hasil dari penggabungan Principal Component Analysis (PCA) dengan algoritma Neural Network dengan nilai akurasi 97.3%, recall (sensitivitas) 97.3%, spesifisitas 97.8%, F1-Score 97.3%, MCC 94.6?n AUC 99.7%.Dalam penelitian ini, dilakukan klasifikasi data ekspresi gen menggunakan algoritma klasifikasi machine learning yang dikombinasikan dengan reduksi dimensi PCA dalam mendeteksi leukemia AML sehingga diharapkan penggunaan PCA dapat meningkatkan kinerja algoritma klasifikasi machine learning dan menghasilkan akurasi yang tinggi dalam mendeteksi leukemia AML.