ANALISIS VARIASI
GEN CSN2 EXON 7 PADA SAPI PERAH FRIESIAN HOLSTEIN DI PETERNAKAN RAKYAT
CV. MAWAR MEKAR KABUPATEN KARANGANYAR
Susmita
Firliani
H0521122
Penelitian
ini dilakukan bertujuan untuk menganalisis adanya variasi gen CSN2 exon 7 serta
alel-alel penyusunnya pada sapi perah Friesian Holstein di peternakan rakyat.
Total 13 ekor sapi perah FH dipeternakan rakyat diambil sampel darah untuk
dilakukan ekstraksi DNA genom. Hasil ekstraksi DNA diamplifikasi dengan
menggunakan forward primer 5’-ACCCCAATTTCTTAACCAAACCA-3’ dan reverse
primer 5’-CATCAGAAGTTAAACAGCACAGT-3’ untuk menghasilkan produk PCR dengan
ukuran 683 bp. Produk PCR disequencing untuk mendapatkan urutan nukleotida
gen CSN2 exson 7. Urutan nukleotida yang diperolah dianalisis dengan
menggunakan BioEdit ver.7.2 dan Clustal Omega untuk penyelarasan sekuens untuk
mengidentifikasi ada tidaknya perubahan basa nitrogen penyusun kodon dan asam
amino. Hasil analisis data didapatkan variasi gen CSN2 exon 7 pada c.350A>C
jika dilihat dari kromatogram primer forward. Subtitusi basa nitrogen A menjadi
C pada c.350A>C mengubah kodon (CAT) menjadi kodon (CCT) sehingga terjadi
perubahan asam amino yang bersifat missense yang menjadi penentu susu A2.Variasi
genotipe sapi perah dalam penelitian ini terdapat 2 individu genotipe A2A2
dengan alel CC, 2 individu genotipe A1A1 dengan alel AA dan 9 individu genotipe
heterozigot A1A2 dengan variasi alel AC. Variasi genotip A2A2 alel CC
mengahasilkan susu A2 yang aman dikonsumsi karena tidak menghasilkan peptida
BCM-7 sehingga tidak menimbulkan permasalahan diare dan intoleransi
laktosa pada konsumen.
