Diversitas Genetik Intra dan Inter Spesies Sapi Bali dari Sumbawa dan Sapi Aceh Berdasarkan Analisis Mikrosatelit

Oleh :
Prasasti Wahyu Haryati - M0406048 - Fak. Sastra dan Seni Rupa

Sapi-sapi yang terdapat di Indonesia mempunyai karakteristik yang berbeda-beda. Perbedaan karakteristik tersebut salah satunya disebabkan karena adanya diversitas genetik. Salah satu penanda genetik untuk mengetahui diversitas genetik adalah mikrosatelit. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui diversitas genetik intra dan inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan sapi Aceh berdasarkan analisis mikrosatelit. Penelitian ini menggunakan sampel darah sapi Bali dari Sumbawa dan sapi Aceh yang di ambil menggunakan metode venopuncture, masing-masing sebanyak 20 individu. DNA diekstrak dari total darah dengan menggunakan teknik Wizard Genomic Purification System. Fragmen DNA diamplifikasi dengan PCR menggunakan primer berturut-turut ETH225, TGLA227, INRA005, BM1824 dan MM12. DNA produk PCR dideteksi menggunakan teknik elektroforesis gel poliakrilamid 12% yang dilanjutkan dengan metode pewarnaan ethidium bromida. Data yang diperoleh dianalisis dengan menggunakan program POPGENE version 1.31. Hasil analisis alel-alel mikrosatelit menunjukkan bahwa jumlah alel setiap lokus pada intra maupun inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan sapi Aceh bervariasi antara 1 sampai 3 alel. Rata-rata nilai Shannon's Information index pada intra spesies sapi Bali dari Sumbawa adalah 0.45, intra spesies sapi Aceh 0.75, sedangkan pada inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan Aceh 0.75. Rata-rata nilai heterozigositas pada intra spesies sapi Bali dari Sumb awa 0.46, intra spesies sapi Aceh 0 68, sedangkan pada inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan Aceh 0.57. Hasil ini menunjukkan bahwa keragaman genetik pada intra spesies sapi Aceh lebih tinggi dibandingkan intra spesies sapi Bali dari Sumbawa dan inter spesies sapi Bali dari Sumbawa dan Aceh.