Kloning Dan Analisis Molekuler Cdna Penyandi Protein Ns4a Virus Hepatitis C 1A Isolat Jawa Tengah

Oleh :
EVA NOELFIASMA - G0007065 - Fak. Kedokteran

Tujuan: Penelitian Ini Bertujuan Untuk Mendapatkan Plasmid Pet-HCV NS4A Dan Analisis Molekuler Gen Penyandi Protein NS4A HCV 1a Isolat Jawa Tengah. Metode: Penelitian Ini Bersifat Eksploratif Analitik. Complementary DNA (Cdna) Penyandi Protein NS4A Pada Isolat HCV 1a 09IDSKAC-20 Dikloning Dengan Menggunakan Metode PCR. Analisis Molekuler Dilakukan Dengan Mengaligmentasi Sekuens Isolat 09IDSKAC-20 Dengan Seluruh Sekuens NS4A HCV 1a Yang Telah Dilaporkan Di Genbank. Kemudian, Dilanjutkan Dengan Analisis Pada Tingkat Nukleotida, Asam Amino Dan Motif Yang Terdapat Pada NS4A. Hasil: Hasil Sekuensing NS4A Isolat HCV 09IDSKAC-20 Menunjukkan Konsistensi Kodon Penyandi Asam Amino Yang Diketahui Berperan Dalam Kompleks Replikasi Yaitu Residu Yang Terletak Pada Membrane Anchor (Gly8, Leu13, Ala14, Tyr16, Cys17 Dan Gly21). Variasi Asam Amino Ke-22, 29 Dan 30 Mengindikasikan Isolat Tersebut Telah Mengalami Perubahan Aktivitas Protease NS3 Di NS5A-5B Junction Dan Perubahan NS4A-Dependent Internal Cleavage Yang Berpengaruh Pada Transformasi NS3. Motif Yang Ditemukan Pada Sekuens Isolat 09IDSKAC-20 Adalah Motif EFDEMEE Yang Berperan Dalam Mengatur Aktivitas Atpase Dari Helikase NS3. Simpulan: Plasmid Pet-HCV NS4A Yang Mengandung Gen Penyandi Protein NS4A HCV 1a Isolat Jawa Tengah Telah Berhasil Didapatkan. Hasil Analisis Molekuler Menunjukkan Terdapat Residu-Residu Yang Terkonservasi Sempurna Pada NS4A Yang Diduga Berperan Penting Dalam Replikasi Virus. Adanya Variasi Asam Amino Beberapa Residu Dan Motif NS4A Perlu Diteliti Lebih Lanjut Terutama Hubungannya Dengan Efisiensi Replikasi, Patogenisme Dan Keberhasilan Terapi. Kata Kunci: NS4A, HCV 1a, Kloning, Analisis Molekuler