Analisis Molekuler Regio Pre-S1, Pre-S2, Dan S Isolat Virus Hepatitis B 09idskab-3

Oleh :
Angga Dwi Prasetyo - G0009014 - Fak. Kedokteran

Latar Belakang: Virus Hepatitis B (VHB) Diketahui Sebagai Salah Satu Penyakit Menular Paling Berbahaya Di Dunia. VHB Merupakan Jenis Virus Untai Ganda Sirkuler Deoxyribonucleic Acid (DNA) Yang Bereplikasi Dengan Transkripsi Balik. Mutasi Genetik Regio Pre-S1, Pre-S2, Dan S VHB Sering Terjadi Selama Proses Trankripsi Balik Tersebut. Studi Ini Bertujuan Untuk Menganalisis Genotipe, Subtipe, Dan Variasi Genetik Pada Regio Pre-S1, Pre-S2, Dan S Isolat VHB 09IDSKAB-3 Yang Diperoleh Dari Komunitas Man Who Have Sex With Man Di Surakarta. Metode: Produk Ekstraksi DNA VHB 09IDSKAB-3 Digunakan Sebagai Cetakan Untuk Amplifikasi Regio Pre-S1, Pre-S2, Dan S. Sekuens Yang Diperoleh Selanjutnya Disejajarkan Dengan Metode Clustal W Dengan Reference Sequences (Genotipe A-H) Yang Dilaporkan Di Genbank/DDBJ/EMNL. Genotipe VHB Ditentukan Dengan Analisis Phylogenetic. Subtipe VHB Ditentukan Berdasarkan Beberapa Asam Amino Yang Berada Pada Sekuens Hbsag. Variasi Genetik Di Regio Pre-S1, Pre-S2, Dan S Diidentifikasi Dengan MEGA 4.0. Hasil: Berdasarkan Hasil BLAST Dari Genbank, Isolat VHB 09IDSKAB-3 Diklasifikasikan Ke Dalam Genotipe B3. Phylogenetic Tree Menunjukkan Bahwa Isolat VHB 09IDSKAB-3 Diklasifikasikan Ke Dalam Genotipe B3. Berdasarkan Beberapa Asam Amino Yang Berada Pada Sekuens Hbsag, Isolat VHB 09IDSKAB-3 Diklasifikasikan Ke Dalam Subtipe Adw2. Variasi D27E Ditemukan Pada Regio Pre-S1 Dan Tidak Ditemukan Adanya Variasi Genetik Pada Regio Pre-S2 Maupun S. Simpulan: Secara Keseluruhan, Isolat VHB 09IDSKAB-3 Termasuk Ke Dalam Genotipe B3 Dan Subtipe Adw2. Di Dalam Studi Ini Hanya Ditemukan Variasi D27E. Variasi Tersebut Diindikasikan Dapat Merubah Proses Replikasi VHB, Oleh Karena Itu Diperlukan Penelitian Lebih Lanjut Untuk Mengetahui Pengaruh Variasi Tersebut.