Dinamika Reaktivasi Y220c-P53 Oleh Adduct Mq-Sistein

Oleh :
Thera Femaleda Laban - M0307079 - Fak. MIPA

Pembentukkan adduct MQ-Sistein merupakan salah satu mekanisme yang diketahui dapat mengembalikan fungsi p53. Mutasi Y220C-p53 (mutasi tirosin menjadi sistein) kehilangan fungsi p53 sebagai gen penekan tumor. Mutasi tersebut menginduksi suatu cavity pada residu 220 dan mengubah stabilitas termalnya. Sistein 220 yang berada didalam cavity diketahui dapat menjadi target obat. Di sisi lain, beberapa sistein pada p53 DNA binding domain dapat membentuk adduct MQ-Sistein. Banyaknya sistein yang ada menjelaskan bahwa mekanisme restorasi belum sepenuhnya diketahui. Simulasi dinamika molekuler dari Y220C-p53 yang mengandung adduct MQ-Sistein telah kami lakukan untuk memahami mekanisme tersebut. Trajectory-trajectory hasil simulasi selama 100 ns menunjukkan adanya perubahan kestabilan karena penambahan adduct. Perubahan tersebut dapat ditandai oleh perubahan pada konformasi backbone protein. Sistein pada lokasi yang berbeda memberikan pengaruh interaksi yang berbeda, sehingga memungkinkan terjadinya perbedaan perubahan konformasi. Adduct MQ-Sistein pada residu 220 dan 275 menunjukkan perubahan konformasi yang relatif sama pada loop 1 dan loop 3 (L1 dan L3). Oleh sebab itu, kami menduga bahwa adduct MQ-Sistein menginduksi modifikasi local, dan mengubah sebagian konformasi Y220C-p53 menyerupai wild type-p53.