Analisis Keragaman Genetik Pada Tanaman Ganyong (Canna Edulis Ker.) Berdasarkan Penanda Rapd (Random Amplified Polymorphic Dna)

Oleh :
Yovita Widya Asmara - S901208012 - Sekolah Pascasarjana

Ganyong (Canna edulis ker.) merupakan salah satu umbi-umbian dengan kandungan gizi dan manfaat besar yang dapat kita jumpai di Indonesia. Dalam pengembangan dan pemanfaatan tanaman ganyong diperlukan beberapa informasi genetik. Namun di Indonesia, informasi genetik masih sangat terbatas. Penelitian bertujuan untuk mengetahui informasi genetik berdasarkan keragaman pola pita DNA dari beberapa daerah antar varietas ganyong putih dan merah dengan metode RAPD. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Agustus sampai Desember 2013 bertempat di Laboratorium Genetika dan Pemuliaan Tanaman Fakultas Pertanian Universitas Gadjah Mada, Yogjakarta. Bahan penelitian adalah daun tanaman ganyong dari daerah Solo, Karanganyar dan Boyolali. Tahap penelitian meliputi : isolasi DNA, uji kualitas dan kuantitas DNA, seleksi primer dan amplifikasi menggunakan PCR. Visualisasi hasil PCR dilakukan dengan elektroforesis yang menghasilkan pola pita DNA. Data hasil penelitian dianalisis menggunakan program NTSYSpc (Numerical Taxonomy and Multivariate Análisis System) versi 2.02i dengan metode Unweight Pair Group Method Arithmetic (UPGMA) fungsi SIMQUAL (Similarity Qualitative). Hasil penelitian menunjukkan bahwa amplifikasi menggunakan primer OPA-01, OPB-03, OPB-05, OPB-14, dan OPB-19 menghasilkan pola pita DNA yang menunjukkan keragaman antar varietas keragaman antar varietas ganyong merah dan ganyong putih dari daerah Solo, Karanganyar dan Boyolali. Dendogram gabungan primer menunjukkan ganyong putih Boyolali memisah tersendiri dari kelima sampel lainnya pada koefisien kemiripan 0,71.