Penelitian ini bertujuan untuk menilai kepatuhan Kantor Akuntan Publik Mahsun, Nurdiono, Kukuh & Rekan (MNK & PARTNERS) dalam menerapkan standar audit yang tercantum pada Standar Profesional Akuntan Publik untuk melaksanakan audit laporan keuangan milik BLUD Puskesmas. Penulis menggunakan metode penelitian kualitatif dengan data primer dan sekunder yang diperoleh melalui observasi langsung pada saat pelaksanaan audit serta melakukan studi literatur terkait Standar Audit. Standar Audit terdiri dari standar umum, standar pekerja lapangan audit, dan standar pelaporan. Pada penelitian ini penulis juga menjelaskan bagaimana proses audit laporan keuangan pada BLUD Puskesmas yang terdapat beberapa kendala dalam pelaksanaanya dan mencoba menjelaskan prosedur alternatif yang digunakan auditor dalam mengatasi kendala tersebut.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa pelaksanaan audit di Kantor Akuntan Publik Mahsun, Nurdiono, Kukuh & Rekan (MNK & PARTNERS) telah sesuai dengan standar audit yang berlaku. Namun, terdapat ketidaksesuaian antara perencanaan dengan pelaksanaan audit yang nantinya akan berpengaruh ke beberapa hal yang akan menghambat dalam pelaksanaan audit laporan keuangan sehingga penulis disini mencoba memberikan saran dan masukan untuk Kantor Akuntan Publik Mahsun, Nurdiono, Kukuh & Rekan (MNK & PARTNERS) agar dapat merencanakan kembali perencanaan audit tersebut dengan sebaik mungkin.
