Pendahuluan: Anatomi merupakan ilmu penting sebagai pintu untuk mengenal cara kerja tubuh, hubungan struktur tubuh yang berubah karena penyakit, serta dasar dari mahasiswa kedokteran untuk melakukan pemeriksaan fisik pada pasien. Saat ini, mahasiswa menganggap anatomi sebagai ilmu yang sulit. Oleh karena itu, dibutuhkan suatu metode pembelajaran anatomi dengan media pembelajaran yang lebih efektif.  Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui perbedaan efektivitas aplikasi mobile SMARTnatomy Cardio dengan atlas pada mahasiswa fakultas kedokteran.

Metode: Penelitian ini merupakan penelitian eksperimental kuasi dengan desain equivalent control group design yang dilaksanakan di Fakultas Kedokteran Universitas Sebelas Maret Surakarta. Sampel dari penelitian ini adalah 66 mahasiswa kedokteran yang diambil dengan teknik purposive sampling. Variabel bebas adalah aplikasi mobile SMARTnatomy Cardio dan atlas anatomi. Variabel terikat adalah efektivitas media pembelajaran anatomi. Data yang diperoleh berupa nilai pretest, post test, dan kenaikan nilai. Data kemudian dihitung menggunakan perangkat lunak SPSS dan dianalisis menggunakan Mann Whitney U-Test dan Wilcoxon Test.

Hasil: Hasil pengujian didapatkan atlas anatomi dan aplikasi mobile SMARTnatomy Cardio sama – sama efektif sebagai media pembelajaran anatomi (p = 0,000). Namun, terdapat perbedaan yang signifikan pada pada nilai post test 2 kelompok (p = 0,035) dimana atlas anatomi sedikit lebih efektif dibandingkan aplikasi mobile SMARTnatomy Cardio (p = 0,017).

Simpulan: Terdapat perbedaan efektivitas aplikasi mobile SMARTnatomy Cardio dengan atlas pada mahasiswa fakultas kedokteran.