Studi Dinamika Molekuler Ligan Siklik Peptida ACRGDWCG sebagai Modulator Integrin αIIbβ3
Penulis Utama
:
Shinta Ayu Wicaksono Putri
NIM / NIP
:
M0319075
×<p>Sistem penghantaran obat menuju otak terhalang oleh blood brain barrier (BBB). Obat dapat melewati BBB melalui jalur Receptor mediated Transcytosis (RMT), melibatkan interaksi ligan dan reseptor. Reseptor integrin dalam tubuh manusia yaitu αvβ1, αvβ3, αvβ5, αvβ6, αvβ8, α5β1, α8β1, dan αIIbβ3 mengenali motif ligan Arg-Gly-Asp (RGD). Menariknya motif struktur motif ligan dan susunan asam amino yang mengapit RGD mempengaruhi besar afinitas reseptor, sifat biologis, dan selektivitas reseptor. Integrin α5β1 sebagai endotel integrin membentuk kompleks dengan cRGD (Kode PDB 4WK4). Selektivitas ligan cRGD diamati terhadap headpiece integrin αIIbβ3 dengan linear RGD (Kode PDB 3ZDY) digunakan sebagai referensi. Simulasi Dinamika Molekular (MD) selama 50 ns dilakukan masing-masing terhadap headpiece integrin bebas ligand, kompleks headpiece integrin dan linear RGD dan kompleks headpiece integrin dan cRGD. Analisis kemudian dilakukan menggunakan modul CPPTRAJ dari paket program Amber 20 untuk mengamati perubahan konformasi headpiece integrin terhadap ikatan ligand RGD selama simulasi. Hasil analisis menunjukkan ligan cRGD menginduksi perubahan konformasi headpiece integrin secara alosterik selama 50 ns sedangkan ligan linear RGD tidak ada perubahan konformasi. Struktur dan asam amino di ligand cRGD memberikan kontribusi terhadap besarnya energi afinitas untuk pembukaan headpiece integrin. Oleh karena itu, modulasi obat dengan ligan peptide cRGD yang selektif akan memberikan keuntungan lebih baik untuk mekanisme penghantaran.</p>
×
Penulis Utama
:
Shinta Ayu Wicaksono Putri
Penulis Tambahan
:
-
NIM / NIP
:
M0319075
Tahun
:
2024
Judul
:
Studi Dinamika Molekuler Ligan Siklik Peptida ACRGDWCG sebagai Modulator Integrin αIIbβ3
