Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui posisi taksonomi dari N. adrianii yang dianggap cryptic species in taxonomy dibandingkan dengan N. spathulata ditinjau dari karakterisasi morfologi dan genetik. Penelitian dilaksanakan dengan pengambilan sampel N. adrianii di area Gunung Slamet di Jawa Tengah dan N. spathulata di Gunung Kunyit di Jambi. Karakter morfologi N. adrianii dan N. spathulata dianalisis dengan pengamatan pada organ batang, daun, dan kantong. Desain primer dilakukan dengan Primer3Plus, OligoAnalyzer Tool, dan Primer-BLAST. Hasil karakterisasi morfologi menunjukkan bahwa N. adrianii dan N. spathulata memiliki kekerabatan yang sangat dekat ditinjau dari karakter kuantitatif dan dendogram dengan koefisien 0,92 dan mengelompok dalam 1 kelompok. Analisis parameter abiotik menggunakan PCoA menunjukkan N. adrianii dan N. spathulata masuk pada elips yang sama, sehingga keduanya hidup pada habitat serupa. Desain primer spesifik pada genus Nepenthes berhasil dilakukan dengan produk MkNs1 dan RbNs4 dengan suhu annealing berturut-turut adalah 53°C dan 54°C berukuran panjang produk 800-900bp. Sekuen N. adrianii berdasarkan analisis BLAST menunjukkan similaritas tinggi dengan N. spathulata 99,75% pada gen matK, 98,81% pada gen ITS, dan 99,45 pada pairwise alignment rbcL. SNP menunjukkan sekuen matK dari N. adrianii dan N. spathulata terdapat 4 site polimorfik. Pada sekuen ITS terdapat 3 site polimorfik, dan pada sekuen rbcL terdapat 8 site polimorfik. Conserve site berada diatas 98,9% pada ketiga gen yang menunjukkan kemiripan sangat tinggi. Konstruksi pohon filogenetik menggunakan gen matK, ITS, dan rbcL menunjukkan N. adrianii dan N. spathulata berada dalam kelompok yang sama.