Penelitian ini bertujuan untuk (1) Mengetahui tingkat pemahaman peserta didik dalam materi ekosistem, (2) Mengembangkan media pembelajaran Ecoducator berbentuk aplikasi Android pada materi ekosistem berbasis riset, serta (3) Mengetahui kevalidan media pembelajaran Ecoducator berbentuk aplikasi Android pada materi ekosistem berbasis riset. Penelitian ini merupakan penelitian Research and Development. Sumber data penelitian meliputi data angket, yang meliputi angket soal three tier-test yang digunakan untuk melihat tingkat pemahaman peserta didik. Angket lainnya adalah angket validasi untuk media pembelajaran Ecoducator yang dikembangkan. Hasil penelitian adalah sebagai berikut. Pertama, tingkat pemahaman peserta didik terhadap materi Ekosistem dapat dikategorikan dalam enam kategori, yaitu paham konsep, miskonsepsi false positive, miskonsepsi false negative, miskonsepsi murni, menebak, dan tidak paham. Berdasarkan hasil respon angket soal, diketahui bahwa persentase tertinggi pemahaman peserta didik terdapat pada ketiga miskonsepsi jika digabungkan, yaitu miskonsepsi false positive, miskonsepsi false negative, serta miskonsepsi murni. Kedua, Pengembangan media Ecoducator pada materi Ekosistem dilakukan dengan menggunakan model pengembangan 4D, yang meliputi pendefinisian (define), perancangan (design), pengembangan (develop), dan penyebaran (disseminate). Akan tetapi dalam penelitian kali ini hanya metode define, design, dan develop yang digunakan. Karena penelitian hanya sampai pada uji validasi media, yaitu validasi oleh ahli materi dan ahli media. Karakteristik media Ecoducator pada materi Ekosistem adalah memuat materi tentang riset pendugaan karbon pada area sekitar. Materi meliputi tujuan, aspek yang diukur, langkah-langkah, cara menduga, serta aktivitas tentang pendugaan karbon pada area sekitar. Materi pendugaan karbon dapat digunakan untuk mempelajari materi siklus karbon pada sub materi siklus biogeokimia. Ketiga, Media Ecoducator pada materi Ekosistem telah dinyatakan layak untuk menjadi media pembelajaran. Penilaian ahli media yang memiliki nilai persentase 94% yang termasuk pada kategori sangat valid. Penilaian ahli materi memiliki nilai persentase sebesar 90% yang termasuk dalam kategori sangat valid. Sehingga media pembelajaran Ecoducator layak untuk dilakukan uji coba.