Kopi liberika merupakan salah satu kopi yang memiliki nilai pasar paling rendah jika dibandingkan dengan jenis kopi lainnya yaitu sebesar 5%. Karakterisasi Bakteri Asam Laktat dari buah kopi liberika dapat memberikan referensi ilmiah dalam dunia penelitian. Hal ini dikarenakan, proses identifikasi molekuler menggunakan 16S rRNA memberikan hasil yang lebih akurat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hasil karakterisasi bakteri asam laktat (BAL) dari buah kopi liberika dan mengetahui hasil identifikasi analisis filogenetik bakteri asam laktat (BAL) pada buah kopi liberika berdasarkan sekuens 16S rRNA.

Dalam penelitian ini terdapat 3 isolat Bakteri Asam Laktat yang diberi kode BAL01, BAL02, dan BAL03. Isolasi DNA bakteri dilakukan dengan metode manual, kemudian di amplifikasi menggunakan PCR untuk kemudian di visualisasi di geldoc. Hasil PCR product gen 16S rRNA yang memiliki nukleotida 1200-1500 bp dilakukan sekuensing. Setelah itu, hasil sekuensing dilakukan Contig Assambly Program (CAP) untuk mensejajarkan sekuens dan dilakukan konstruksi pohon filogenetik.

Hasil dari penelitian ini menunjukkan bahwa isolat BAL01, BAL02, dan BAL03 merupakan benar Bakteri Asam Laktat dibuktikkan dari hasil karakterisasi secara morfologis dan kontruksi kekerabatan bakteri menggunakan pohon filogenetik. Untuk hasil molekuler berdasarkan sekuens 16S rRNA hasil BLASTN pada NCBI ( www.ncbi.nlm.nih.gov ) menghasilkan BAL01 memiliki kemiripan 100% dengan Enterococcus hirae strain 708, BAL02 memiliki kemiripan 100% dengan Enterococcus hirae strain 13152, dan BAL03 memiliki kemiripan 100% dengan Lactiplantibacillus plantarum strain 1625.