Bencana merupakan suatu peristiwa alam yang ekstrem dan berpotensi menimbulkan bahaya bagi hidup, harta benda, dan aktivitas manusia. Pada tahun 2020 seluruh negara dikejutkan dengan penemuan virus baru bernama Serve Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS- CoV-2). Kota Yogyakarta memiliki kasus tinggi sebanyak 33.887 jiwa yang terkonfirmasi positif Covid-19 pada tahun 2022. Kenaikan kasus ini tidak hanya disebabkan oleh kontak langsung seperti bersin dan sentuhan fisik, tetapi juga oleh penularan tidak langsung, salah satunya dapat dilihat dari keberadaan prasarana kota. Prasarana yang terdiri dari MCK, air bersih, persampahan dan jaringan jalan berpotensi dalam penyebaran kasus konfirmasi Covid-19. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui hubungan keberadaan prasarana kota terhadap tingkat persebaran Covid-19 di Kota Yogyakarta. Penelitian ini dilakukan menggunakan teknik analisis pemetaan spasial dengan Sistem Informasi Geografis (SIG) menggunakan overlay dan analisis korelasi linear. Hasil penelitian menunjukkan prasarana persampahan dan jaringan jalan yang memiliki korelasi yang kuat dalam tingginya konfirmasi kasus. Adanya kekhawatiran akan penularan virus maka adanya perubahan pola transportasi seperti peningkatan penggunaan kendaraan pribadi. Masyarakat yang dahulu menggunakan angkutan umum beralih menggunakan kendaraan pribadi yang dapat meningkatkan kemacetan di jalanan sehingga berdampak pada sebaran Covid-19. Selain itu, keberadaan TPS juga dapat menjadi variabel dalam mempengaruhi kasus covid-19. Penelitian ini juga mengidentifikasikan bahwa diperlukannya peningkatan peran dalam meminimalisir tingginya sebaran Covid-19 maupun wabah lainnya yang dimana terjadi akibat adanya hubungan prasarana yang ada di lingkup wilayah Kota Yogyakarta.