Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui peningkatan kemampuan berpikir kritis siswa melalui penerapan e-modul ajar berbasis Problem Based Learning (PBL) yang didukung oleh platform Microsite.id pada materi Perubahan Iklim. Penelitian ini menggunakan metode Penelitian Tindakan Kelas (PTK) dengan dua siklus yang masing-masing terdiri atas tahap perencanaan, pelaksanaan, observasi, dan refleksi. Subjek penelitian adalah siswa kelas XC SMA Negeri 7 Surakarta. Data dikumpulkan melalui observasi, wawancara, dan tes berpikir kritis, serta dianalisis secara kualitatif dan kuantitatif. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penggunaan e-modul ajar berbasis PBL dapat meningkatkan kemampuan berpikir kritis siswa, yang ditunjukkan oleh peningkatan nilai N-Gain dari 0,40 (kategori sedang) dengan rata-rata persentase kemampuan berpikir kritis sebesar 76,94?n persentase ketuntasan siswa sebesar 69,4% pada siklus I dan perolehan nilai N-Gain 0,75 (kategori tinggi) dengan rata-rata persentase kemampuan berpikir kritis sebesar 90,28?n persentase ketuntasan siswa sebesar 100% pada siklus II. Ketercapaian 5 indikator kemampuan berpikir kritis pada tahap prasiklus masih berada di bawah 70%, pada siklus I terdapat 3 indikator yang mencapai target penelitian, dan pada siklus II semua indikator mencapai target penelitian dengan karegori sangat tinggi. Hasil ini merekomendasikan penerapan e-modul berbasis Microsite.id dalam pembelajaran fisika sebagai alternatif inovatif untuk meningkatkan keterampilan berpikir kritis. Khususnya, pada indikator membangun keterampilan dasar, memberikan penjelasan lebih lanjut, serta mengatur strategi dan taktik.