ANALISIS VARIASI GEN CSN2 EXON 7 PADA SAPI PERAH FRIESIAN HOLSTEIN DI PETERNAKAN RAKYAT CV. MAWAR MEKAR KABUPATEN KARANGANYAR

Susmita Firliani

H0521122

ABSTRAK

Penelitian ini dilakukan bertujuan untuk menganalisis adanya variasi gen CSN2 exon 7 serta alel-alel penyusunnya pada sapi perah Friesian Holstein di peternakan rakyat. Total 13 ekor sapi perah FH dipeternakan rakyat diambil sampel darah untuk dilakukan ekstraksi DNA genom. Hasil ekstraksi DNA diamplifikasi dengan menggunakan forward primer 5’-ACCCCAATTTCTTAACCAAACCA-3’ dan reverse primer 5’-CATCAGAAGTTAAACAGCACAGT-3’ untuk menghasilkan produk PCR dengan ukuran 683 bp. Produk PCR disequencing untuk mendapatkan urutan nukleotida gen CSN2 exson 7. Urutan nukleotida yang diperolah dianalisis dengan menggunakan BioEdit ver.7.2 dan Clustal Omega untuk penyelarasan sekuens untuk mengidentifikasi ada tidaknya perubahan basa nitrogen penyusun kodon dan asam amino. Hasil analisis data didapatkan variasi gen CSN2 exon 7 pada c.350A>C jika dilihat dari kromatogram primer forward. Subtitusi basa nitrogen A menjadi C pada c.350A>C mengubah kodon (CAT) menjadi kodon (CCT) sehingga terjadi perubahan asam amino yang bersifat missense yang menjadi penentu susu A2.Variasi genotipe sapi perah dalam penelitian ini terdapat 2 individu  genotipe A2A2 dengan alel CC, 2 individu genotipe A1A1 dengan alel AA dan 9 individu genotipe heterozigot A1A2 dengan variasi alel AC. Variasi genotip A2A2 alel CC mengahasilkan susu A2 yang aman dikonsumsi karena tidak menghasilkan peptida BCM-7 sehingga tidak menimbulkan permasalahan diare dan intoleransi laktosa pada konsumen.