Diversitas Genetik Sapi Peranakan Ongole (Po), Sapi Aceh, dan Sapi Sumbawa Berdasarkan Polimorfisme pada Fragmen Nd-5 Dna Mitokondria dengan Teknik Pcr-Rflp
Penulis Utama
:
Syarifa Zahrah
NIM / NIP
:
S900809020
×Diversitas genetik merupakan dasar dalam perkawinan ternak, karena dapat digunakan sebagai awal peningkatan kualitas ternak melalui seleksi artificial. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui polimorfisme pada fragmen ND-5 DNA mitokondria pada sapi Peranakan Ongole, Aceh, dan Sumbawa dan diversitas genetiknya. DNA total dari darah sapi lokal di ekstrak dengan menggunakan Wizard genomic DNA purification system dari Promega dan diamplifikasi menggunakan teknik PCR. Hasil produk PCR kemudian dipotong dengan menggunakan enzim Hind III menggunakan teknik RFLP untuk mendeteksi polimorfisme. Diversitas genetik dari sapi Peranakan Ongole, Aceh dan Sumbawa dianalisis menggunakan formula dari Nei dan hubungan kekerabatannya dengan program NTSYSpc versi 2.02i. Berdasarkan hasil penelitian terdapat polimorfisme pada fragmen ND-5 DNA mitokondria. Pemotongan dengan enzim restriksi Hind III menghasilkan dua macam haplotipe. Haplotipe B merupakan fragmen DNA yang tidak terpotong oleh enzim Hind III dengan ukuran fragmen sebesar 453 bp, dan haplotipe A merupakan fragmen DNA yang terpotong ole enzim Hind III menjadi dua dengan ukuran fragmen 336 bp dan 117 bp. Polimorfisme ditemukan pada sapi Peranakan Ongole, tetapi pada sapi Sumbawa dan Aceh tidak ditemukan. Diversitas haplotipe pada fragmen ND-5 DNA mitokondria sapi Peranakan Ongole sebesar 0.6250 sedangkan sapi Sumbawa dan Aceh tidak terdapat diversitas haplotipe. Hubungan kekerabatan menunjukkan sapi Sumbawa berada dalam satu klaster dengan sapi Peranakan Ongole dan terpisah dengan sapi Aceh.
×
Penulis Utama
:
Syarifa Zahrah
Penulis Tambahan
:
-
NIM / NIP
:
S900809020
Tahun
:
2011
Judul
:
Diversitas Genetik Sapi Peranakan Ongole (Po), Sapi Aceh, dan Sapi Sumbawa Berdasarkan Polimorfisme pada Fragmen Nd-5 Dna Mitokondria dengan Teknik Pcr-Rflp
