Analisis Molekuler Hcv (Hepatitis C Virus) Regio E1-E2 Dan Ns5b Pasien Hiv Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi Di Surakarta

Penulis Utama : Rizki Nisfi Ramdhini
NIM / NIP : S901108007
× Sekitar 15-30% dari pasien dengan HIV (Human immunodeficiency Virus) diperkirakan koinfeksi dengan HCV (Hepatitis C Virus). Pasien koinfeksi HIV-HCV lebih mungkin untuk progresivitas sirosis dan risiko AIDS. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi infeksi HCV pasien HIV di Rumah Sakit Umum Moewardi Surakarta dan analisis motif esensial di sebagian region HCV E1-E2 dan HCV NS5B. Sebanyak 100 sampel plasma diperoleh dari 100 pasien HIV di VCT (voluntary counselling and testing) di Rumah Sakit Umum Moewardi Surakarta. Dalam studi ini, deteksi RNA HCV meliputi isolasi asam nukleat, sintesis cDNA, amplifikasi menggunakan nested PCR dan sequencing produk PCR. Hasil sekuensing di-aligment dengan semua sekuen genotipe HCV yang dilaporkan di database GenBank. Identifikasi genotipe HCV berdasarkan analisis filogenetik dan analisis molekuler dilakukan menggunakan software MEGA5. RNA HCV positif terdeteksi pada satu sampel dari 37 sampel anti- HCV positif dan satu sampel dari 63 anti-HCV negatif. Hasil ini menunjukkan bahwa HCV dapat mengalami koinfeksi dengan pasien HIV. Hasil tersebut merupakan petunjuk terhadap pentingnya pemeriksaan HCV terhadap pasien HIV. Sekuensing nukleotida regio NS5B dan E1-E2 menunjukkan satu isolat diidentifikasi sebagai genotipe 1a dan satu isolat sebagai genotipe campuran 1a dan 3k. Di regio E1 terjadi variasi alanine di residu 369. Epitop I regio E2 terjadi variasi di I414V dan T416S (isolat D8-26), dan N417G T416A (isolat D8-87), sedangkan epitop II regio E2 terjadi variasi di W437F, L438I, Q444Y dan H445N (isolat D8-26); L438I, F442I, Q444R dan H445Y (isolat D8-87). Regio NS5B ditemukan variasi di motif A RdRp NS5B yaitu D220Y (isolat D10-87) sedangkan di motif B dan C tidak ditemukan variasi asam amino baik di isolat D10-26 dan D10-87.Variasi tersebut diketahui tidak menurunkan kesensitivan terhadap antibodi monoklonal dan terapi antiretroviral (ARV)
×
Penulis Utama : Rizki Nisfi Ramdhini
Penulis Tambahan : -
NIM / NIP : S901108007
Tahun : 2014
Judul : Analisis Molekuler Hcv (Hepatitis C Virus) Regio E1-E2 Dan Ns5b Pasien Hiv Rumah Sakit Umum Daerah Dr. Moewardi Di Surakarta
Edisi :
Imprint : Surakarta - Pascasarjana - 2014
Program Studi : S-2 Biosains
Kolasi :
Sumber : UNS-Pascasarjana Prodi.Biosain-S901108007-2014
Kata Kunci :
Jenis Dokumen : Tesis
ISSN :
ISBN :
Link DOI / Jurnal : -
Status : Public
Pembimbing : 1. Afiono Agung Prasetyo dr., Ph.D
Penguji :
Catatan Umum :
Fakultas : Sekolah Pascasarjana
×
File : Harus menjadi member dan login terlebih dahulu untuk bisa download.