Isolasi, Identifikasi dan Deteksi Gen Ice Nucleation Active Bakteri pada Tumbuhan Berdaun Lebar Di Jalur Pendakian Cemoro Sewu Gunung Lawu

Penulis Utama : Ria Karno
NIM / NIP : S901302007
× ABSTRAK RiaKarno. NIM. S901302007. Isolasi, Identifikasi dan Deteksi Gen Ice Nucleation Active Bakteri pada Tumbuhan Berdaun Lebar Di Jalur Pendakian Cemoro Sewu Gunung Lawu. Pembimbing I: Prof. Drs. Sutarno, M.Sc., Ph.D., Pembimbing II: Dr. Ari Susiolowati, M.Si. Tesis: Program Studi Biosain, Program Pascasarjana, Universitas Sebelas Maret Surakarta. 2014. Bakteri Ice Nucleation Active (INA) adalah bakteri filosfer yang mampu menyebabkan luka beku (frost injury) pada permukaan daun tanaman dan berperan dalam biopresipitasi. Penelitian dan informasi tentang bakteri INA di daerah subtropis telah banyak dilakukan, namun di daerah tropis masih sedikit. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat, menentukan spesies berdasarkan gen penyandi 16S rRNA dan mengetahui hubungan kekerabatan bakteri INA yang diisolasi dari tumbuhan berdaun lebar di jalur pendakian Cemoro Sewu, Gunung Lawu yaitu 6 spesies tumbuhan berdaun lebar serta mengetahui gen penyandi protein pembentuk inti es bakteri INA. Isolasi bakteri INA dilakukan dengan metode spread plate pada media Nutrient agar + gliserol (NAG) dan media King’s B. Aktivitas nukleasi es ditentukan dengan metode tube nucleation test menggunakan circulating alcohol bath. Estimasi populasi ditentukan berdasarkan tabel MPN. Amplikon gen 16S rRNA dilakukan dengan Polymerase Chain Reaction (PCR) menggunakan 63 forward primer dan 1387 reverse primer. Hubungan kekerabatan ditentukan berdasarkan pohon filogenetik menggunakan program MEGA 5.1. Deteksi gen ina dilakukan dengan PCR menggunakan primer forward dan reverse dari inaZ, inaA, inaW serta inaX. Sekuens DNA dianalisis untuk mengetahui kemiripan dengan gen daribakteri INA lain yang ada di situs NCBI secara online. Hasil penelitian didapatkan 3 isolat bakteri INA. Isolat A2N4 dari tumbuhan Dodonae viscose Jacq memiliki similaritas 96% dengan Pseudomonas syringae. Isolat C2N9 dari tumbuhan Vaccinium laurifolium memiliki similaritas 97% dengan Pantoea sp dan isolat F1N6 dari tumbuhan Polygonum chinense L yang teridentifikasi memiliki similaritas 98% dengan Pseudomonas sp. Populasi bakteri yang ditemukan tergolong rendah yakni <3 x 103/g hingga 5,4 x 103/g daun. Bakteri INA dari jalur pendakian Cemoro Sewu, Gunung Lawu dan bakteri INA yang ditemukan sebelumnya memilki hubungan kekerabatan yang dekat. Hasil analisis sekuens gen ina menunjukkan gen pada isolat A2N4 mempunyai similaritas 99 % dengan gen pengkode ice nucleation protein pada Pseudomonas syringae, strain INA4. Kata kunci: Bakteri Ice Nucleation Active (INA), deteksi gen, filogenetik, tumbuhan berdaun lebar, Cemoro Sewu, Gunung Lawu.
×
Penulis Utama : Ria Karno
Penulis Tambahan : -
NIM / NIP : S901302007
Tahun : 2014
Judul : Isolasi, Identifikasi dan Deteksi Gen Ice Nucleation Active Bakteri pada Tumbuhan Berdaun Lebar Di Jalur Pendakian Cemoro Sewu Gunung Lawu
Edisi :
Imprint : Surakarta - Pascasarjana - 2014
Program Studi : S-2 Biosains
Kolasi :
Sumber :
Kata Kunci :
Jenis Dokumen : Tesis
ISSN :
ISBN :
Link DOI / Jurnal : -
Status : Public
Pembimbing : 1. Prof. Drs. Sutarno, M.Sc., Ph.D
2. Dr. Ari Susiolowati, M.Si
Penguji :
Catatan Umum :
Fakultas : Sekolah Pascasarjana
×
File : Harus menjadi member dan login terlebih dahulu untuk bisa download.