ABSTRAK
Perairan air tawar yang menggenang (lentik) mudah mengalami
pencemaran. Penyebab pencemaran perairan air tawar antara lain masuknya limbah
domestik dan limbah sektor pertanian di sekitar perairan yang berupa bahan organik
dan anorganik, sehingga perairan tersebut mengandung nutrien yang tinggi dan
dapat menyebabkan sedimentasi. Selain itu, diperkirakan kadar nitrat juga tinggi di
perairan tersebut. Kadar nitrat yang tinggi dapat menyebabkan terjadinya
eutrofikasi dan penurunan kualitas air di perairan tersebut, sehingga dibutuhkan
suatu cara pencegahan atau penanggulangan dengan memanfaatkan
mikroorganisme perairan yaitu bakteri denitrifikasi. Bakteri ini dapat mengubah
nitrat menjadi gas nitrogen (N2) dalam keadaan anaerob, sehingga kandungan nitrat
di perairan dapat berkurang. Tujuan penelitian ini adalah; (1) mengidentifikasi
isolat-isolat bakteri denitrifikasi yang diisolasi dari sedimen perairan Rawa Jombor
dengan karakterisasi bakteri denitrifikasi dan (2) mengetahui status trofik perairan
Rawa Jombor berdasarkan parameter lingkungan kecerahan, nitrogen dan fosfor.
Penelitian ini dilakukan isolasi bakteri denitrifikasi dari sedimen perairan
Rawa Jombor dengan menggunakan media denitrifikasi cair dan padat, uji reduksi
nitrat, uji oksidatif/fermentatif, karakterisasi bakteri dengan pewarnaan gram dan
identifikasi bakteri denitrifikasi dengan sekuen gen penyandi 16S rRNA yang
dianilisis dengan BLASTn. Status trofik perairan Rawa Jombor berdasarkan
parameter nitrogen total, fosfor total dan kecerahan yang dianalisis dengan kriteria
status trofik danau yang terlampir pada Peraturan Menteri Negara Lingkungan
Hidup (Per MNLH) No. 28 Tahun 2009.
Pada penelitian ini, ditemukan 6 isolat bakteri denitrifikasi yang diisolasi
dari sedimen di perairan Rawa Jombor Klaten. Karakteristik isolat bakteri tersebut
adalah koloni berwarna bening, berbentuk bulat, bersifat gram negatif, selnya
berbentuk batang dan motil. Satu isolat yaitu isolat TmK tidak teridentifikasi,
sehingga isolat yang dapat diidentifikasi ada 5 isolat bakteri denitrifikasi. Lima
isolat bakteri denitrifikasi yang ditemukan teridentifikasi termasuk ke dalam genus
Shewanella. Isolat TmD (99%) teridentifikasi sebagai Shewanella putrefaciens,
isolat TmE (98%) dan TmG (97%) memiliki kemiripan dengan Shewanella
putrefaciens, isolat Tmi (98%) memiliki kemiripan dengan Shewanella xiaminensis
dan isolat TmA (96%) merupakan spesies baru. Status trofik perairan Rawa Jombor
berdasarkan parameter nitrogen total, fosfor total dan kecerahan termasuk dalam
status hipereutrof.