VALIDASI JUMLAH SIKLUS AMPLIFIKASI YFILER PADA MANUSIA


1),2)Program Studi Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta
3) Laboratorium DNA, Pusat Kedokteran dan Kesehatan Polri, Jakarta
ABSTRAK
Di dalam laboratorium forensik, pengungkapan suatu kasus tindak
kriminal Di dalam laboratorium forensik, pengungkapan suatu kasus tindak
kriminal dapat dilakukan melalui identifikasi DNA manusia. Salah satu cara
identifikasi DNA manusia dapat dilakukan melalui analisis kromosom Y. Yfiler
adalah sebuah kit komersial yang dapat digunakan dalam analisis kromosom Y.
Namun, penggunaan Yfiler terbilang baru di Indonesia, khususnya di
Laboratorium DNA Pusdokkes Polri, Jakarta. Oleh karena itu, Yfiler perlu
divalidasi untuk membuktikan ketepatgunaan dan akurasi fungsi dari kit tersebut.
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui jumlah siklus amplifikasi
Yfiler tervalid, serta hubungan antara jumlah siklus dengan rata-rata tinggi peak,
dan persamaan regresi yang terbentuk.
Dalam penelitian ini, validasi dilakukan dengan cara memodifikasi jumlah
siklus amplifikasi. Jumlah siklus amplifikasi yang digunakan adalah 27, 28, 29,
30, 31, dan 32 siklus. Data dianalisis dengan menggunakan aplikasi Gene
Mapper® ID Software v 3.2, serta diuji homogenitas dan signifikansi
menggunakan ANOVA dengan probabilitas 5% (α=0,05). Penentuan model kurva
standar dilakukan menggunakan SPSS Statistic v. 20. Jumlah siklus tervalid
ditentukan dengan memilih rata-rata tinggi peak dari masing-masing jumlah
siklus, yang mendekati nilai median rata-rata tinggi peak standar (100 – 10.000
RFU). Kemudian, hasil yang diperoleh dibandingkan dengan hasil validasi yang
dilakukan petunjuk manual AmpFlSTR® Yfiler® PCR Amplification Kit.
Jumlah siklus amplifikasi tervalid yang diperoleh dari penelitian ini adalah
pada jumlah siklus 31. Hubungan antara jumlah siklus amplifikasi dengan ratarata
tinggi peak mengikuti bentuk kurva S, yaitu setiap penambahan jumlah siklus
amplifikasi akan diikuti dengan penambahan tinggi peak, dengan persamaan
regresi: .
Kata kunci: validasi, Yfiler, kromosom Y, amplifikasi, jumlah siklus, kurva S