Penulis Utama | : | Imam Samodra |
NIM / NIP | : | S061908004 |
Merebaknya virus COVID-19 membuat para peneliti terus menyelidiki beberapa senyawa aktif yang terdapat pada tanaman yang berpotensi menghambat virus COVID-19. Penelitian ini mengevaluasi senyawa kuersetin bergugus gula yang terdapat pada buah okra dengan menggunakan pendekatan Molecular docking untuk menghambat Mpro COVID-19. Proses docking dilakukan menggunakan AutoDock Vina. Lipinski’s Rule of Five dan OSIRIS Property Explorer juga digunakan untuk mengetahui kriteria keamanan senyawa jika akan digunakan sebagai obat. Tools package dari Amber 20 digunakan untuk mengkarakterisasi perilaku dinamis dan stabilitas protein dalam hubungannya dengan semua senyawa. Analisis RMSD, 2D RMSD dan B-factor menunjukkan kompleks Mpro dengan Quercetin-3-O-rhamnoside, Quercetin 7-O-glucoside, Quercetin -4'-O-glucoside terdapat perubahan konformasi yang signifikan. Analisis MMPBSA menjelaskan dengan adanya gugus gula membuat interaksi yang terjadi menjadi dinamis sehingga mampu mengubah konformasi. Efek gugus gula yang membuat interaksi menjadi dinamis sehingga mampu menghambat fungsi Mpro COVID-19 yang ditemukan dalam penelitian ini dapat menjadi titik awal untuk menghasilkan obat terapeutik COVID-19 dari bahan alami.