Tujuan penelitian ini adalah untuk : (1) Mengetahui pengaruh pembelajaran dengan metode CIRC dan NHT terhadap prestasi belajar pada materi pokok Struktur Atom. (2) Mengetahui pengaruh minat siswa terhadap prestasi belajar pada materi pokok Struktur Atom dengan metode CIRC dan NHT. (3) Mengetahui adanya interaksi antara pembelajaran dengan metode CIRC dan NHT dan minat siswa terhadap prestasi belajar pada materi pokok Struktur Atom. Penelitian ini menggunakan metode quasi eksperimen. Populasi penelitian adalah siswa kelas X semester I SMA Negeri 2 Klaten tahun pelajaran 2009/2010. Pengambilan sampel dilakukan dengan cara cluster random sampling. Teknik pengumpulan data yang digunakan adalah angket untuk minat belajar siswa dan tes obyektif untuk mengukur prestasi belajar siswa pada materi pokok Struktur Atom. Teknik analisis data yang digunakan adalah analisis variansi dua jalan sel tak sama. Sebagai persyaratannya adalah uji keseimbangan dengan uji t dua pihak, uji normalitas dengan uji Lilliefors dan uji homogenitas dengan metode Bartlet. Dari hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa : (1) terdapat pengaruh pembelajaran dengan metode CIRC dan NHT terhadap prestasi belajar siswa pada materi pokok Struktur Atom yang ditunjukkan dengan harga Fobs = 5,099 yang melampaui harga Ftabel = 4,000 (N = 74, pada taraf signifikansi 5%). (2) terdapat pengaruh minat belajar siswa terhadap prestasi belajar siswa pada materi pokok Struktur Atom, yang ditunjukkan dengan harga Fobs = 6,375 yang melampaui harga Ftabel = 4,000 (N = 74, pada taraf signifikansi 5%). (3) tidak ada interaksi antara metode pembelajaran CIRC dan NHT dengan minat belajar siswa terhadap prestasi belajar pada materi pokok Struktur Atom dengan harga Fobs = 0,919 kurang dari Ftabel = 4,000 (N = 74, pada taraf signifikansi 5%).