Biofuel pada saat ini dianggap sebagai salah satu bahan bakar yang mampu menggantikan peran dari bahan bakar minyak berbahan dasar fosil. Terlebih dengan kondisi cadangan minyak mentah yang kian menipis, tentu bahan bakar pengganti yang berbahan dasar terbarukan sangat diperlukan. Dalam suatu sistem rantai pasok produk biofuel, terdapat beberapa hal yang membutuhkan perhatian lebih bagi sebuah Suply chain managment atau SCM. Hal – hal tersebut adalah emisi karbon yang dihasilkan pada saat proses produksi biofuel, membuat suatu sistem inspeksi terhadap biofuel impur, namun tetap menghasilkan jumlah total keuntungan rantai pasok yang maksimal. Dalam penelitian ini, akan dikembangkan model yang dapat mendukung sistem rantai pasok biofuel menjadi lebih optimal, namun dengan tetap mempertimbangkan emisi karbon yang dihasilkan dalam rantai pasok. Dalam penelitian ini diterapkan tiga variabel keputusan yaitu harga jual pengecer , periode waktu siklus  dan kualitas produk