Malaria merupakan penyakit menular yang disebabkan oleh parasit Plasmodium dan ditularkan melalui nyamuk Anopheles, dengan prevalensi tertinggi kedua di Indonesia setelah Papua yaitu Nusa Tenggara Timur (NTT), khususnya di kabupaten Sumba Timur, Sumba Barat, dan Sumba Barat Daya. Jumlah kejadian malaria di Nusa Tenggara Timur (NTT) tahun 2023 adalah sebanyak 6966 kasus. Data kejadian malaria di Nusa Tenggara Timur (NTT) tahun 2023 mengalami overdispersi yang menyebabkan pelanggaran asumsi equidispersi dalam regresi Poisson, yaitu ketika nilai variansi lebih besar daripada rata-rata. Permasalahan overdispersi pada data ini dapat diatasi dengan model Generalized Poisson Regression (GPR) yang mampu mengatasi variansi berlebih dalam data kejadian malaria. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan model regresi Poisson dan Generalized Poisson Regression (GPR) pada data jumlah kejadian malaria di Nusa Tenggara Timur (NTT) tahun 2023. Data variabel respons berupa jumlah kejadian malaria dan variabel prediktornya berupa luas panen padi, akses sanitasi layak, tinggi wilayah, curah hujan, kepadatan penduduk, luas wilayah, jumlah penduduk, tempat BAB bersama, garis lintang, dan garis bujur setiap kabupaten/kota. Data diperoleh dari publikasi Badan Pusat Statistik (BPS) Nusa Tenggara Timur tahun 2023. Berdasarkan pemodelan terbaik dengan kriteria Akaike Information Criterion (AIC), variabel yang berpengaruh signifikan terhadap kejadian malaria adalah jumlah curah hujan dan jumlah penduduk.