Pertumbuhan eceng gondok (Eichhornia crassipes) yang tidak terkendali pada Waduk Cengklik menimbulkan permasalahan operasional berupa penyempitan jalur perairan, penurunan kualitas lingkungan, serta keterbatasan kinerja kapal pembersih konvensional dalam menjangkau area dangkal dan sempit, sehingga diperlukan solusi rekayasa yang lebih adaptif. Penelitian ini bertujuan untuk merancang kapal pembersih eceng gondok berbasis sistem semiotomatis yang mampu beroperasi secara efektif pada kondisi perairan tersebut, serta mengevaluasi kinerja struktural komponen kritis berupa conveyor. Metode yang digunakan meliputi identifikasi kebutuhan pengguna melalui pendekatan Voice of Customer, penerjemahan kebutuhan ke dalam parameter teknis menggunakan Quality Function Deployment, serta evaluasi dan seleksi konsep melalui metode Multi Attribute Decision Making. Hasil perancangan menunjukkan bahwa konsep terpilih memiliki konfigurasi kompak dengan sistem kendali jarak jauh serta integrasi sub sistem utama yang meliputi hull, blade, conveyor, trash box, ramp plate, dan thruster, sehingga mampu mendukung proses pengambilan, pemindahan, dan penampungan eceng gondok secara efektif dan berkesinambungan. Analisis struktural terhadap conveyor menunjukkan bahwa komponen tersebut memiliki kebutuhan daya yang relatif rendah serta mampu menahan beban operasional dengan nilai tegangan dan faktor keamanan yang masih berada dalam batas yang diizinkan. Dengan demikian, desain yang dihasilkan dinilai memenuhi aspek fungsional, struktural, dan operasional, serta berpotensi menjadi solusi yang efektif, efisien, dan berkelanjutan dalam pengendalian eceng gondok pada perairan dangkal.