Struktur Komunitas Bakteri Endofit pada Empat Spesies Anggrek Epifit yang ditemukan di Taman Nasional Gunung Merbabu Berdasarkan Analisis Metagenomik
Penulis Utama
:
Liana Putri Puspitasari
NIM / NIP
:
M0419044
×<p>Taman Nasional Gunung Merbabu (TNGMb) merupakan kawasan konservasi yang menyimpan kekayaan hayati, salah satunya yaitu tumbuhan anggrek epifit. Penelitian tentang struktur komunitas bakteri endofit pada anggrek epifit di TNGMb belum banyak dilakukan. Terdapat empat spesies anggrek epifit yang ditemukan pada penelitian ini: <em>Bulbophyllum compressa, Dendrobium tenellum, Dendrobium sagittatum, </em>dan <em>Pholidota carnea</em>. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui struktur komunitas bakteri endofit pada 4 spesies anggrek epifit yang ditemukan di hutan TNGMb yang meliputi komposisi, keanekaragaman dan kelimpahan berdasarkan analisis metagenomik dengan menggunakan sekuens gen 16S rRNA. Pengambilan sampel akar anggrek dilakukan di kawasan hutan Resort Ampel dan Wonolelo Taman Nasional Gunung Merbabu. Sterilisasi permukaan dilakukan dengan cara direndam dalam etanol 70% selama 30 detik lalu dilanjutkan dengan perendaman larutan sodium hipoklorit 1% selama 30 detik. Sampel selanjutnya dilakukan ekstraksi DNA, amplifikasi sekuens, dan sekuensing. Data OTU yang diperoleh digunakan untuk mengetahui diversitas alfa dan beta serta distribusi komposisi bakteri endofit dalam komunitas. <em>B. compressa</em> dan <em>D. tenellum</em> memiliki kelimpahan dan diversitas tertinggi. Keempat sampel didominasi oleh Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, dan Bacteroidota. Beberapa genus yang ditemukan dengan kelimpahan tinggi antara lain: <em>Pseudomonas, Serratia, Bifidobacterium, Acinetobacter, </em>dan<em> Escherichia-shigella</em></p>
×
Penulis Utama
:
Liana Putri Puspitasari
Penulis Tambahan
:
-
NIM / NIP
:
M0419044
Tahun
:
2024
Judul
:
Struktur Komunitas Bakteri Endofit pada Empat Spesies Anggrek Epifit yang ditemukan di Taman Nasional Gunung Merbabu Berdasarkan Analisis Metagenomik
Edisi
:
Imprint
:
Surakarta - Fak. MIPA - 2024
Program Studi
:
S-1 Biologi
Kolasi
:
Sumber
:
Kata Kunci
:
bakteri endofit, anggrek epifit, analisis metagenomik, Taman Nasional Gunung Merbabu
Jenis Dokumen
:
Skripsi
ISSN
:
ISBN
:
Link DOI / Jurnal
:
-
Status
:
Public
Pembimbing
:
1. Dr. Ari Susilowati, S.Si., M.Si. 2. Dr. Artini Pangastuti, S.Si., M.Si.
