Identifikasi aktivator adenosine monophosphate-activated protein kinase sebagai kandidat antikanker menggunakan molecular docking pada database herbal Indonesia

Penulis Utama : Farchan Azzumar
NIM / NIP : G0011090
× Latar Belakang: Peningkatan aktivitas Adenosine Monophosphate-Activated Protein Kinase (AMPK) terbukti dapat menghentikan siklus sel dan dapat menghambat semua jalur biosintesis sel yang diperlukan untuk pertumbuhan sel kanker. Berbagai penelitian melaporkan telah ada enam puluh senyawa yang dapat mengaktifkan AMPK tetapi senyawa-senyawa tersebut dinilai kurang selektif terhadap pengaktifan AMPK. Oleh karena itu, perlu dilakukan penelitian secara efektif untuk menemukan aktivator AMPK yang lebih selektif. Adenosine monophosphate (AMP) terbukti dapat secara langsung mengaktifkan AMPK, tetapi konsentrasinya pada sel kanker menurun. Peneliti menggunakan molecular docking untuk membantu menemukan senyawa aktif dari Database Herbal Indonesia (HerbalDB) yang memiliki kemiripan interaksi AMP pada AMPK. Metode Penelitian: Sampel yang dilakukan docking adalah data virtual senyawa aktif (1) yang terdaftar pada HerbalDB (2) memiliki struktur tiga dimensi dan (3) memenuhi kriteria Lipinski Rule of Five. Penelitian ini menggunakan metode molecular docking untuk mencari senyawa aktif yang memiliki kemiripan interaksi dengan AMP pada AMPK. Program molecular docking yang digunakan adalah AutoDock Vina version 1.1.2 dan program visualisasi yang digunakan adalah Chimera 1.9. Hasil Penelitian: Penelitian ini menggunakan 473 senyawa aktif yang terkandung didalam tanaman herbal Indonesia. Docking dan visualisasi pada penelitian ini memperlihatkan beberapa senyawa yang memiliki skor docking yang lebih rendah dari pada AMP (-7,5 Kal/mol, -8,3 Kal/mol, -8,6 Kal/mol) dan dapat menempati tiga tempat ikat pada subunit ? AMPK. Simpulan Penelitian: Penelitian ini menyimpulkan beberapa senyawa yang terkandung didalam tumbuhan obat Indonesia memiliki kemiripan terhadap aktivitas AMP pada AMPK karena dapat menempati tempat ikat AMP pada AMPK sehingga diharapkan dapat mengaktifkan AMPK dan menjadi kandidat anti kanker. Kata Kunci: AMPK, Herbal, Molecular Docking
×
Penulis Utama : Farchan Azzumar
Penulis Tambahan : -
NIM / NIP : G0011090
Tahun : 2015
Judul : Identifikasi aktivator adenosine monophosphate-activated protein kinase sebagai kandidat antikanker menggunakan molecular docking pada database herbal Indonesia
Edisi :
Imprint : Surakarta - F. Kedokteran - 2015
Program Studi : S-1 Pendidikan Dokter
Kolasi :
Sumber : UNS-F. Kedokteran Jur. Kedokteran-G.0011090-2015
Kata Kunci :
Jenis Dokumen : Skripsi
ISSN :
ISBN :
Link DOI / Jurnal : -
Status : Public
Pembimbing : 1. Dono Indarto, dr., M.Biotech. St., Ph.D
2. Balgis, dr., MSc., CM.FM., Sp.Ak
Penguji :
Catatan Umum :
Fakultas : Fak. Kedokteran
×
File : Harus menjadi member dan login terlebih dahulu untuk bisa download.