Penelitian ini bertujuan untuk meneliti faktor-faktor yang mempengaruhi agency cost dalam perspektif mekanisme corporate governance dengan kualitas audit sebagai variabel moderasi pada Perusahaan Manufaktur di Bursa Efek Indonesia Tahun 2011-2012. Penelitian ini menggunakan Hutang sebagai variabel kontrol. Penelitian ini menggunakan metode purposive sampling. Dengan metode tersebut didapatkan sampel sejumlah 86 Perusahaan Manufaktur di Bursa Efek Indonesia. Data yang diperoleh tersebut diolah dengan menggunakan analisis regresi linier berganda dan uji kendall untuk variabel dependen yang tidak berdistribusi normal. Hasil penelitian menunjukkan bahwa mekanisme corporate governance yang baik melalui proksi jumlah keberadaan dewan komisaris independen dari perusahaan yang diteliti tidak mempunyai berpengaruh terhadap agency cost melalui 4 proksi antara lain 1) Asset Utilisation Ratio 2) Discretionary Expenditure Ratio 3) Tobin’s Q Ratio 4) Interaction of Free Cash Flow and Growth. Sedangkan Kualitas audit yang diduga memoderasi hubungan antara mekanisme corporate governance dengan agency cost terbukti tidak dapat memperkuat atau memperlemah hubungan tersebut. Bagi penelitian selanjutnya, dapat menambah variabel-variabel lain diluar penelitian ini.