Penderita autisme memiliki kondisi khusus yang mengakibatkan penderitanya perlu menjalani terapi diet bebas gluten dan kasein. Gluten terkandung dalam tepung terigu yang biasa digunakan dalam pembuatan cookies komersil. Diperlukan substitusi bahan lain pada cookies yang dapat menggantikan gizi tepung terigu yaitu tepung uwi dan tepung tempe koro pedang. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik fisik, kimia, dan sensoris cookies Gluten Free Casein Free (GFCF) berbahan tepung uwi dan tepung tempe koro pedang serta pemilihan formulasi terbaik cookies. Penelitian ini menggunakan RAL (Rancangan Acak Lengkap) satu faktor dengan analisa menggunakan One Way ANOVA. Hasil penelitian menunjukkan adanya pengaruh perbandingan tepung uwi dan tepung tempe koro pedang terhadap karakteristik cookies GFCF. Formula terbaik cookies GFCF yaitu F2 (80% tepung uwi : 20% tepung tempe koro pedang) dengan karakteristik kimia yaitu kadar air sebesar 11,80%; kadar abu 1,86%; kadar protein 6,95%; kadar lemak 16,53%; dan kadar karbohidrat 74,66%. Karakteristik fisika yaitu tingkat kecerahan (L*) sebesar 41,80; indeks kemerahan (a*) 11,35; indeks kekuningan (b*) 24,14; nilai hue 64,79; dan kekerasan 10,88 N. Dan karakteristik sensoris yaitu tingkat kesukaan warna mendapat skor 4,07; aroma mendapat skor 3,83; rasa mendapat skor 3,73; tekstur mendapat skor 3,77; serta overall mendapat skor 3,70.