Simulasi perhitungan dosis serap pada terapi proton metode pencil beam scanning dilakukan untuk kanker retinoblastoma menggunakan software MCNP6. Sel kanker dimodelkan berbentuk rubik 3×3×3 dengan rusuk 0,3 cm. Penyinaran menggunakan berkas proton berukuran 0,05 cm ditembakkan dari arah serong kiri depan mata dan diarahkan ke-27 kubus kecil agar diperoleh nilai isodosis pada setiap bagian sel kanker. Pada penelitian ini digunakan 5 variasi energi dengan rentang 45-49 MeV dan step 1 MeV. Hasil simulasi menunjukkan rata-rata dosis serap sel kanker sebesar (4,51 ± 0,59) × 10-8 Gy/p dengan tingkat isodosis sebesar 86,82% yang membuat distribusi dosis serap proton pada sel kanker relatif merata. Jaringan sehat yang menerima dosis serap terbesar adalah badan bening yang memiliki perbandingan dengan sel kenker yaitu 2,64% relatif kecil dibandingkan dengan dosis serap sel kanker.