Budidaya bawang merah yang dilakukan saat ini menggunakan menggunakan bahan tanam umbi yang berpotensi membawa virus. Biji botani menjadi alternatif yang dapat dipilih sebagai bahan tanam Pembungaan dan pembentukan biji bawang merah di dataran rendah masih tergolong rendah. Usaha yang dilakukan yaitu menggunakan cara pengaplikasian pupuk dan memilih varietas yang sesuai untuk mendukung pembungaan dan pembentukan biji bawang merah. Penelitian dilakukan di ketinggian 129 mdpl dengan Rancangan Acak Kelompok Lengkap faktorial. Faktor yang pertama yaitu cara pemupukan, terdiri dari pemupukan cara tabur dan cara kocor. Faktor kedua yaitu varietas bawang merah, terdiri dari Bima Brebes, Bauji, Tajuk, dan Batu Ijo. Cara pemupukan tabur berpengaruh signifikan meningkatkan bobot biji per tangkai, bobot biji per rumpun, dan bobot biji per petak pada varietas Bauji. Pemupukan cara kocor memberikan waktu pembungaan yang lebih cepat dibandingkan dengan cara tabur. Varietas Bima Brebes memberikan waktu pembungaan tercepat dari seluruh varietas dan varietas Tajuk memberikan bobot bunga per rumpun tertinggi.