Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan media pembelajaran berbasis video animasi dengan berbantuan Powtoon. Penelitian ini dilakukan karena peserta didik masih kesulitan dalam memahami materi struktur kontrol percabangan dan perlunya alternatif media yang dapat dimanfaatkan dalam kegiatan pembelajaran. Salah satu solusinya yaitu mengembangkan media pembelajaran berbasis video dengan pendekatan CTL (Contextual Teaching and Learning). Penelitian ini termasuk jenis R&D (Research and Development). Penelitian ini untuk tahap pengembangan media pembelajaran berbasis video animasi ini menggunakan metode 4-D (Define, Design, Develop, Disseminate) dan tahap uji kelayakan oleh ahli materi, ahli media dan respon peserta didik. Hasil penelitian pada tahap pengembangan menunjukkan media pembelajaran sudah baik dan dapat digunakan dalam kegiatan pembelajaran. Selanjutnya kelayakan media pembelajaran menunjukkan hasil dari ahli materi dan ahli media dengan keterangan layak untuk dijadikan media pembelajaran, dan dari respon peserta didik pada indikator pertama penggunaan media mendapatkan hasil 87% dengan kriteria sangat baik, indikator  kedua reaksi pemakaian mendapatkan hasil 85% dengan kriteria sangat baik, indikator yang ketiga manfaat pemakaian mendapatkan hasil 82% dengan kriteria sangat baik, indikator yang keempat fasilitas pendukung mendapatkan hasil 84% dengan kriteria sangat baik. Hasil uji coba keseluruhan untuk respon peserta didik terhadap penggunaan media pembelajaran berbasis video animasi dengan pendekatan CTL (Contextual Teaching and Learning) mendapatkan hasil 84% dengan kriteria sangat baik sehingga layak untuk dijadikan media pembelajaran.